北大课题组最新研究:新冠肺炎病毒中间宿主或为水貂

时间:2020-01-25 18:17:15  来源:搜虎网  作者:青鸾传媒
(原标题:北大课题组最新研究提示:新型冠状病毒中间宿主或为水貂)

新京报快讯 新型冠状病毒的传染源至今未明。北京大学工学院生物医学工程系教授朱怀球团队1月24日发表的研究文章提示,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主,其中水貂可能为中间宿主。

上述研究文章题为“深度学习算法预测新型冠状病毒的宿主和感染性”,发表于bioRxiv预印版平台,研究使用的是基于深度学习算法开发的VHP(病毒宿主预测)方法,用以预测新型冠状病毒潜在宿主。

研究提示,与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比,蝙蝠SARS样冠状病毒与新型冠状病毒具有更相似的感染模式。此外,通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式,发现水貂病毒的传染性模式更接近新型冠状病毒。

这说明,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主。

记者注意到,1月23日,中国科学院武汉病毒研究所研究员石正丽团队在bioRxiv预印版平台上发表文章“一种新型冠状病毒的发现及其可能的蝙蝠起源”。该研究表明,新型冠状病毒的自然宿主最有可能是蝙蝠,它与云南菊头蝠中存在的RaTG13冠状病毒一致性高达96%。

病毒感染力方面,朱怀球团队研究表明,新型冠状病毒的6个基因组都极有可能感染人类。预测结果提示,新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS样冠状病毒(Bat SARS-like CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)类似的感染人类的强大潜力。

【对话】

课题组成员、浙江大学医学院第一医院、传染病诊治国家重点实验室副主任肖永红

“新型冠状病毒与SARS病毒相似度很高”

新京报:研究有哪些主要发现?

肖永红:新型冠状病毒肺炎暴发以来,病毒的传染源一直没有找到。我们利用深度学习算法,分析了现有数据,包括新型冠状病毒及其他冠状病毒的基因序列,以及GenBank(基因数据库)中所有可用的脊椎动物病毒数据等。

研究发现,新型冠状病毒与其他冠状病毒有相似的传染过程。蝙蝠身上有多种冠状病毒,这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物,再传染到人。比如MERS病毒,中间宿主就是骆驼。

对于新型冠状病毒来说,研究预测,蝙蝠是它的最主要来源,中间宿主可能是水貂。

新京报:研究主要基于日前公布的新型冠状病毒全基因序列吗?

肖永红:是的。对科学研究来说,病毒全基因序列非常重要。新型冠状病毒和相似病毒的进化分析,新型冠状病毒的检测方法,都基于全基因序列。另外,病毒发病机制研究、新型冠状病毒治疗药物及疫苗的研发,也基于全基因序列。

新京报:从全基因序列看,新型冠状病毒与SARS病毒有什么关联?

肖永红:我认为它和SARS病毒的类似度很高。首先,新型冠状病毒与SARS病毒同属于冠状病毒的β属,而且两种病毒的基因组序列80%相同,同源性很高。其次,从现有研究看,两种病毒入侵人体细胞的主要受体都是ACE2。第三,新型冠状病毒感染的肺炎发病时间也和SARS相似。

两者不是完全相同的病毒,但关联性很高。



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